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新冠病毒,終將消亡

冠狀病毒屬的病毒是具有蛋白質外殼的正鏈RNA病毒,直徑約80~120nm,其遺傳物質是所有RNA病毒中最大的,該病毒能夠感染人、鼠、豬、貓、犬、狼、雞、牛、禽類脊椎動物(圖1)。從2020年2月10日開始,感染人數在逐步降低,與此同時,治愈人數在不斷上升。這些數據表明,新冠病毒,終將消亡。

圖1 | 冠狀病毒結構示意圖

防控疫情,從“我”做起

面對疫情,我們首先要做的就是防控,預防指南怕是老生常談了,但是重要的事情說幾遍都不為過!

  1. 盡量減少外出,不要去人群聚集處,避免近距離接觸任何有感冒或流感樣癥狀的人;
  2. 外出前往公共場所、就醫和乘坐交通工具時,注意佩戴醫用外科口罩或N95口罩
  3. 不要接觸、購買和食用野生動物(即野味),避免在未加防護的情況下接觸野生動物和家禽家畜;
  4. 注意手衛生,勤洗手,使用洗手液或肥皂,流水洗手,或使用含酒精成分的免洗洗手液;
  5. 打噴嚏或咳嗽時不要用手去捂,要用手肘部或紙巾遮住口、鼻
  6. 居室及工作場所保持清潔,勤開窗,多保持通風狀態
  7. 注意多喝水、多休息、避免熬夜、適度運動,以提高個體免疫能力;
  8. 注意營養、合理飲食,肉類、禽類和蛋類要充分煮熟后食用;

科技助力,服務大眾

在做好第一步的防控疫情后,接下來做好關于抗病毒藥物的研發,而病毒藥物的研發首先要求我們了解病毒的基本信息,此時基因組與轉錄組的高通量測序技術均發揮了重要作用。2月3日,Nature雜志在線發表題目為A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin的學術論文,該文獻通過基因組的高通量測序技術發現在其中5名病人身上獲取的全長度基因組序列彼此之間相似度超過99.9%,與SARS冠狀病毒有約79.5%的序列一致。此外,研究人員發現該新型冠狀病毒序列與一種蝙蝠冠狀病毒在全基因組水平上相似度高達96%,表明蝙蝠可能是該新型冠狀病毒的來源(圖2)。

圖2 | 核酸序列相似度

無獨有偶,2月3日,Nature雜志在線發表題目為A new coronavirus associated with human respiratory disease in China的學術論文,之后同樣是通過基因組高通量測序技術將該新型病毒基因組進行測序,同時對完整病毒基因組(29,903個核苷酸)的系統進化分析表明,該病毒與一組SARS樣冠狀病毒與一種中國蝙蝠體內找到的一組SARS樣冠狀病毒密切相關,達到89.1%核苷酸相似性。PNAS發表的一篇題目為RNA sequencing by direct tagmentation of RNA/DNA hybrids的學術論文,該論文提及的轉座酶建庫的方案則是在轉錄組層面解析新型冠狀病毒。該實驗可在100pg的RNA起始量時檢測近9000個基因。

高通量測序技術在新型冠狀病毒的鑒定中發揮了重要作用,首先通過該技術確認了該病原為以前未知的 β 冠狀病毒,其次確認了該病毒與蝙蝠相關冠狀病毒ZC45和ZXC21密切相關,同源性約為88%,最后高通量測序為后續的診斷提供了強有力的技術支撐。

關于歐易

2009年,從基因芯片技術入手,本著為客戶提供優質而有溫度的高端技術服務這一簡單想法,歐易開啟了事業征程。十余年來,沐風櫛雨,初心不改,從建庫技術到基因芯片技術、二代測序技術、三代測序技術、質譜技術、單細胞測序技術等,我們一直在高通量測序技術領域開拓前行。通過技術開發、流程優化、精良設備引進、優秀人才聚集、持續管理提升,歐易建立起了行業一流的質量標準以及嚴格的質控體系,并始終秉承“硬數據,好服務”的一貫追求,為客戶提供優質的高端技術服務。今天的歐易,以生物科技為核心,以科技服務、分子診斷為兩大主攻方向,正昂首闊步邁向未來。

關于本次疫情歐易生物采取了一系列動作,旨在幫助社會大眾更好的抗擊疫情。

參考文獻

[1] Zhou, P. et al. A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin. Nature https://doi.org/10.1038/s41586-020-2012-7 (2020).

[2] Wu, F. et al. A new coronavirus associated with human respiratory disease in China. Nature https://doi. org/10.1038/s41586-020-2008-3 (2020).

[3] Di, L.et al.RNA Sequencing by Direct Tagmentation of RNA/DNA Hybrids.PNAS http://doi.org/10.1073/pnas.1919800117(2020).

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