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當前位置:首頁 » 新聞資訊 » 技術&解讀&應用 » 微生物多樣性16S產品三大升級 | 全覆蓋分析、美圖、數據挖掘唾手可得

微生物16S多樣性產品大升級,數據分析無死角!

陰雨綿綿的五月已然逝去,酷熱的仲夏悄然而至!

在這個畢業的季節,廣大應屆研究生小伙伴們的經歷也像極了節氣的更替。

然則師兄、師姐皆往矣(即將奔赴各地踏足工作圈),師弟、師妹們心中留下的除了不舍,難免還會疑惑問號吧……

迷惘的少年啊,不用擔心,值此端午佳節之際

送給你,從此實驗無憂,文章多多啦!

端午將至,喜報頻傳,歐易生物16S微生物多樣性產品也迎來了重磅升級,超低的價格,更優質的服務,必將給你帶來非一般的體驗!

廢話不多說,讓我們一起劃重點吧!

分析架構調整,行業流行分析全面覆蓋

九大分析模塊,45項標準分析配置,分析架構即文章寫作架構,七個分析學水平,五種常規距離算法,數據分析面面俱到,無死角。

 

結果呈圖美化,發表級Figure唾手可得

多項分析結果呈圖優化,注重數據展示的同時,兼顧主流SCI期刊配色要求,征服審稿人就是這么簡單。

部分合作客戶發表文章結果展示

 

新增分析6項,助力數據深度挖掘

Circos 樣本與物種關系圖

樣本與物種共線性關系圖是描述樣本與物種之間對應關系的可視化圈圖,不僅能反映每個樣本中優勢物種的組成比例,同時也可以展示各優勢物種在不同樣本中的分布情況。

圖片說明:圈圖左側代表物種,右側代表樣本,不同顏色代表不同的分類學門類和樣本分組。從左往右看,內圈同一顏色線條的粗細代表該物種在不同樣本中的相對豐度;從右往左看,內圈同一顏色線條的粗細代表該樣本中不同物種的組成占比。

 

Ternary三元相圖

Ternary Plot是用一個等邊三角形描述三個變量的不同屬性的比率關系,可以直觀的展示出不同物種在不同樣本(組)中的比重和關系。

圖片說明:三角形的3個角分別代表3個不同樣本(組),不同顏色的圓點代表不同的分類學門類,圓點的大小代表3個樣本(組)中該物種的平均相對豐度,圓點與3個角之間的距離反應該物種在3個樣本(組)中的相對豐度大小。

 

相關性corrplot圖

Corrplot圖可以用圓點的大小和顏色變化來反映二維矩陣或表格中的數據信息,它可以將數據值的大小以定義的圓點大小和顏色深淺進行展示。常用來展示物種與物種或物種與環境因子之間的相關性。

圖片說明:紅色表示負相關,藍色表示正相關,顏色越深、圓點越大則表示相關性越強。

 

Indicator分析

指標性物種是指一定區域范圍內能指示生長環境或某些環境條件的生物種、屬或群落,而Indicator分析常被用來篩選各個樣本組中的指標性物種。

圖片說明:左側的柱狀圖表示不同OTU的豐度信息,右側的氣泡圖橫坐標表示樣本分組信息,氣泡的大小表示每個物種在樣本組中的indicator值大小,即該物種在該分組中的指示性大小。

 

隨機森林分析

隨機森林是一個包含多個決策樹的集成學習方法,其輸出的分類結果是由每棵決策樹“投票”產生的結果。由于每棵樹在構建過程中都采用了隨機變量和隨機抽樣的方法,因此隨機森林的分類結果具有較高的準確度。在微生物多樣性的研究中隨機森林常被用來篩選潛在的生物標記物(Biomarker)。

圖片說明:橫坐標為物種重要性衡量標準值,縱坐標為按物種重要性排序后的物種名稱。

 

系統發育進化樹和物種豐度組合圖

在分子進化研究中,通過推斷物種間系統發生情況來揭示生物進化過程的順序,了解生物進化歷史和機制。選取某一分類水平上優勢物種,利用其代表序列間堿基的差異構建進化樹,并結合heatmap直觀地展示物種分類關系和豐度信息。

圖片說明:左側表示進化樹,不同顏色的樹枝表示不同的分類學門類;右側為heatmap圖,圖中某一格子的顏色越紅表示該物種在對應樣本中豐度越高,格子的顏色越綠表示該物種在對應樣本中豐度越低。

 

篇幅有限,今天小歐就給大家介紹到這里啦!

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