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細胞器亞細胞結構蛋白質組學
亞細胞是蛋白質組學研究的重要方向,是在原有基礎上將研究目標進一步細分,有助于更細致、深入地了解不同亞細胞結構的蛋白對各種因素的響應。
相對于以往常規蛋白組學研究,這些新穎的研究方向對蛋白質組技術特別是樣品制備技術提出了更高的要求。
技術特征
可分析亞細胞種類豐富
目前可以提供線粒體、葉綠體、細胞質等各類主要細胞器的定量蛋白組實驗。
并且還在不斷開發高爾基體、內質網等小細胞器的分離和蛋白質提取技術,努力拓展細胞器蛋白質組學的服務范圍
功能蛋白的精準定位
蛋白的亞細胞定位對于蛋白生物功能的發揮起到關鍵作用,
進行細胞器蛋白質組學研究有利于加快細胞分子生物學機制的理解
特異性蛋白的發現
細胞器蛋白質組學研究通過細胞器分離富集技術與經典蛋白組技術的有效結合,可以有效去除其它細胞器蛋白的干擾,
特異富集目標細胞器專屬蛋白,增強對目標細胞器所屬低豐度表達蛋白的檢測,大大提高蛋白檢測的靈敏度
亞細胞
案例展示
案例一   研究辣椒疫霉菌對番茄侵染過程的相關機制
實驗材料
番茄葉片( 8 h、24 h辣椒疫霉菌侵染組和未侵染組)
研究流程

研究流程


研究結論
差異蛋白的GO分析結果表明,部分細胞核及其進程相關蛋白以及過氧化物酶等非核蛋白可能在疫霉菌侵染過程中被改變
AHL(AT-HOOK-LIKE)蛋白家族可能起到關鍵作用
通過進一步實驗驗證,驗證了AHL作為調控因子,在針對辣椒疫霉菌侵染的免疫過程中發揮作用
參考文獻
Howden AJM. et al., Quantitative analysis of the tomato nuclear proteome during Phytophthora capsici infection unveils regulators of immunity., 2017, New Phytologist.



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